2024年学报（自然版）入选中国科技出版传媒股份有限公司（科学出版社）的中国科技期刊卓越行动计划（二期）集群化试点项目（A类））项目。2025年4月21-24日，由中国科技出版传媒股份有限公司（科学出版社）主办的2025年科学出版社期刊出版年会与科技期刊学术诚信建设研讨会在成都召开，《南京林业大学学报（自然科学版）》副主编吴祝华、李燕文参加了年会与研讨会。
此次论坛聚焦卓越行动计划高起点新刊情况介绍、科学出版社期刊集群和平台建设进展、科技期刊高质量发展的思考与实践、科爱期刊集群国际化发展实践 、我国英文科技期刊的发展阶段发展与思考、从定量看一流科技期刊的特点与思考、 基于媒体融合的期刊学术传播力提升举措 、策划选题的方法与效果， 国产学术期刊的机遇和挑战、群刊协同支持生态环境学科发展、建设国际一流的力学期刊办刊经验分享等，此外，为了让大家了解期刊集群的工作，还特别召开了科学出版社出版合作期刊座谈会。
23-24号召开了科技期刊学术诚信建设研讨会，研讨会聚焦出版伦理与学术出版，可重复性危机背景下出版实践与治理策略研究，国内外科研诚信政策及相关案例分析，伦理审查的国际国内前沿进展与最新要求、 AIGC时代下新型诚信风险与应对、期刊审读工作对科技期刊诚信建设的影响与效应分析等。
